Heiss werden in der Mikrowelle vor allem Stoffe, die wasserhaltig sind. Das aufgewärmte Füllgut gibt die Wärme über den direkten Kontakt ans Glas weiter. Am oberen Rand, wo kein heisses Füllgut das Glas berührt, wird das Glas nicht heiss.
Kurz gesagt: Die Mikrowellen heizen das Glas nicht auf, nur seinen Inhalt.