Japanmatten sind ein hervorragendes Filtermedium. Durch die besonders feste Faserstruktur wird ein guter Wasserdurchfluss und eine grosse Ansiedlungsfläche für Bakterien gewährleistet. Japanmatten müssen zum Reinigen nicht entnommen werden, wenn der grobe Schmutz durch Filterbürsten abgefangen wird. Ein Reinigen ist somit während der ganzen Saison nicht erforderlich. Die Matten werden so gesetzt, dass das Wasser problemlos durchströmen kann und somit der Filter nicht verstopft. Bei jeder Reinigung würde sonst ein grosser Teil der nützlichen Filterbakterien zerstört.