Grand Chien, eine Nation mit reichen natürlichen Ressourcen und tiefen politischen Gräben, wird ins Chaos gestürzt, als der gewählte Präsident verschwindet und eine paramilitärische Truppe namens Die Legion die Kontrolle über das Land übernimmt. Nun hat die Familie des Präsidenten all ihre Ressourcen zusammengezogen, einschliesslich einer Vereinbarung mit dem mächtigen Adonis-Konzern, um eine Gruppe erfahrener Söldner anzuheuern, die den Präsidenten finden und die Ordnung im Land wiederherstellen sollen.

In Jagged Alliance 3 können Sie aus einer Vielzahl von Söldnern wählen, die alle ihre eigenen Persönlichkeiten, Macken und Hintergrundgeschichten haben. Erkunden Sie Grand Chien, lernen Sie neue Leute kennen, verdienen Sie Geld, bauen Sie Ihr Team aus und treffen Sie schliesslich Ihre eigenen Entscheidungen, die über das Schicksal des Landes entscheiden werden.