Im gesamten Fate-Universum haben Paare aus Meistern und heldenhaften Geistern, auch Diener genannt, im Laufe der Geschichte in einer Reihe von Heiligen Gralskriegen gekämpft. Fate/Samurai Remnant setzt den epischen Heiligen Gralskrieg der Serie im vierten Jahr der Keian-Ära im Japan der Edo-Zeit fort. Seit dem Ende einer turbulenten, blutigen Ära sind mehrere Jahrzehnte vergangen, und während die Menschen endlich Frieden und Ruhe geniessen, steht ein Kampf zwischen sieben Paaren von Meistern und ihren Dienern bevor, während das Waxing Moon Ritual im Schatten entfaltet wird. Hier findet sich der Held des Spiels, Miyamoto Iori, ein junger Mann aus Asakusa, zusammen mit seinem Diener Saber, im Kampf um das letzte verbleibende Paar, das das wunschgewährende Artefakt, das Waxing Moon Vessel, erlangen kann.

In Fate/Samurai Remnant übernimmt der Spieler die Kontrolle über Meister Miyamoto Iori, der den Schwertkampfstil Niten Ichiryu studiert hat. Er kämpft an der Seite von Saber, einem Diener mit übermenschlicher Stärke. Bei Begegnungen mit Feinden, die über menschliche Kontrolle hinausgehen, können die Spieler ihren Diener anweisen, mit mächtigen magischen Techniken anzugreifen oder sogar die direkte Kontrolle über den Diener zu übernehmen, um anzugreifen. Dynamische Kampfszenen zwischen Dienern heben die Action auf ein neues Niveau und sind ein Muss für Fans der Serie!

Während des Spiels haben die Spieler die Möglichkeit, die Stadt Edo zu erkunden, wo sich terrassenförmige Häuser, Samurai-Residenzen und Bordelle nebeneinander befinden. Hier wimmelt es von Menschen auf den Strassen, und die Charaktere, mit einem ausgeprägten japanischen Flair, werden zum Leben erweckt. Während sie der Geschichte folgen, können die Spieler mit verschiedenen Charakteren und Tieren in der Stadt interagieren, eine Vielzahl von Bereichen erkunden und sich verschiedenen Herausforderungen stellen, während sie um das Überleben im neuesten Krieg um den Heiligen Gral kämpfen!.